Metabel , metabel

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Pacchetti GenABEL, o * ABEL, è un nome generico per un certo numero di pacchetti software che mirano a facilitare l'analisi statistiche di dati sui genomi polimorfici. Si tratta di un insieme ricco programma, che consente ora molto flessibile genome-wide associazione (GWA) Analisi (GenABEL. ProbABEL. MixABEL. OmicABEL), meta-analisi (MetABEL), parallelizzazione di GWA analisi (ParallABEL), gestione di file molto grandi ( DatABEL), e facilita la valutazione della previsione (PredictABEL). Molto probabilmente, è necessario solo uno dei pacchetti per il vostro compito specifico. Capire quale avete bisogno, di installare e utilizzare! Se avete domande, si prega di consultare la sezione "Supporto" di questo sito. Il codice per le versioni più recenti di sviluppo dei pacchetti è disponibile dalle pagine GenABEL progetto di R-forge o GitHub. Ci si può anche iscriversi alla mailing list con annunci di pacchetti nuovi o aggiornati. Gli archivi della mailing list Annunciare si possono trovare anche lì. Per versioni stabili, utilizzare la versione CRAN per i pacchetti R o link forniti in questo sito analisi di associazione genome-wide per caratteri quantitativi, binaria e il tempo-fino-evento Una libreria R per rilevare gli alleli eterozigoti composti in analisi di associazione genome-wide La meta-analisi di associazione SNP genoma a livello di risultati Genome-wide analisi di associazione per caratteri quantitativi, binaria e il tempo-fino-evento Modelli più misti per l'analisi di associazione genome-wide; la sperimentazione di GSL, più formati di input, iteratore, parallelizzazione attraverso fili. mixed-model rapida basata GWAS gestire in modo efficiente grandi quantità di dati, e sia in singolo tratto e tratto multipla ( "omiche") analizza analisi di associazione sull'intero genoma dei dati imputato Valutare le prestazioni dei modelli di rischio per risultati binari Strumento per Genome-Wide Association Studies per molteplici osservazioni sugli individui correlati analisi della varianza eterogeneità genome-wide come strumento per l'identificazione di SNP potenzialmente interagenti. accesso basata su file di grandi matrici memorizzati sul disco fisso in formato binario parallelizzazione generalizzata di Genome-Wide Association Studies